Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn1mwO35599 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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