Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms