Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms