Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccrl2O35457 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms