Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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