Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf5O35445 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf5O35445 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf5O35445 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf5O35445 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf5O35445 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms