Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KeraO35367 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KeraO35367 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KeraO35367 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KeraO35367 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KeraO35367 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms