Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf11aO35305 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf11aO35305 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms