Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2O35245 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms