Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Nedd9O35177 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nedd9O35177 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms