Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Scarb2O35114 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scarb2O35114 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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