Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn4O35054 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Cldn4O35054 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Cldn4O35054 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Cldn4O35054 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Cldn4O35054 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn4O35054 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn4O35054 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn4O35054 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn4O35054 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms