Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna5O08543 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms