Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8906L7N2A2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms