Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms