Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3542K7N6U2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3542K7N6U2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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