Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm379J3QQ19 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms