Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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