Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21972J3QN38 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm21972J3QN38 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Gm21972J3QN38 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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