Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930544D05RikJ3QK56 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms