Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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