Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4933406M09RikG3XA12 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms