Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms