Protein–RNA interactions for Protein: G3UXL2

Prps1l3, Phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps1l3G3UXL2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps1l3G3UXL2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms