Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms