Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34aG3UW52 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms