Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XntrpcF8VQM8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
XntrpcF8VQM8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms