Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ScaperF8VQ70 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms