Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M1F7CXU4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms