Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm17555F6U8B9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm17555F6U8B9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm17555F6U8B9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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