Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms