Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FancfE9Q5Z5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FancfE9Q5Z5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FancfE9Q5Z5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FancfE9Q5Z5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FancfE9Q5Z5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FancfE9Q5Z5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FancfE9Q5Z5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms