Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BC005561E9Q5E2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BC005561E9Q5E2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BC005561E9Q5E2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms