Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ApobE9Q414 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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