Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms