Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms