Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms