Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3lE9PWZ3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3lE9PWZ3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms