Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931408C20RikE9PWP9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms