Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30bE9PVL6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30bE9PVL6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms