Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444G20RikD3Z741 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms