Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms