Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms