Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms