Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc170D3YXL0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc170D3YXL0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms