Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms