Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc13D3YV10 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms