Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmf1B9EKI3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmf1B9EKI3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms