Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd8B9EJ80 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms