Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm20547B8JJN0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm20547B8JJN0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm20547B8JJN0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm20547B8JJN0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20547B8JJN0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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